Publikációk
Nemzetközi csapatunk kutatói különböző tudományos és orvosi területeken együttműködve az innováció határainak elmozdításán dolgoznak. Alább találja releváns tudományos munkáinkat, amelyeket lektorált tudományos folyóiratokban publikáltak.
Syed A. Hussain, Christina Hofer, Maximilian Högner, Wolfgang Schweinberger, Theresa Buberl, Daniel Bausch, Marinus Huber, Ferenc Krausz, Ioachim Pupeza
2024/09/06
Sub-attosecond-precision optical-waveform stability measurements using electro-optic sampling
A szabályozott optikai hullámformájú lézerimpulzusok előállítása és mérése mind az időtartománybeli, mind a frekvenciatartománybeli precíziós méréstechnika középpontjában áll. Itt 16-femtoszekundumos közeli infravörös impulzusok által vezérelt intraimpulzus-különbségfrekvenciás generálással (IPDFG) közép-infravörös hullámokat állítunk elő, és elektro-optikai mintavételezéssel (EOS) jellemezzük e hullámok szubciklus-frakcióinak a kapuimpulzusokhoz viszonyított időbeli eltérését. Az egyes nullpont-átmeneteknél szub-attoszekundumos időbeli pontosságot és a 10 kHz-0,625 MHz-es sávban 0,1% alatti relatív amplitúdó-ingadozást mutatunk be. A közel oktávnyi közép-infravörös impulzusok frekvenciamodulálása (csörpölése) hullámhosszfüggő attoszekundumos nagyságrendű hullámforma-eltérés kimutatását teszi lehetővé. Tanulmányunk igazolja az EOS-t (electro-optic sampling – elektro-optikai mintavételezés) mint az optikai hullámformák mozgásdinamikájának szélessávú (mind a rádiófrekvenciás, mind az optikai tartományban), rendkívül érzékeny mérési technikáját. Ez az érzékenység az IPDFG és az EOS segítségével kapott hullámformák kiemelkedő stabilitását mutatja, ami közvetlenül előnyös a precíziós mérések számára, beleértve a lineáris és nemlineáris (infravörös) térfelbontású spektroszkópiát. Ezen túlmenően ezek az eredmények képezik az EOS-alapú aktív hullámforma-stabilizáció és a szub-attoszekundumos több oszcillátoros szinkronizáció/késleltetés követés alapját.
Publikáció helye: Scientific Reports
Olvassa el online
PDF megnyitása
Marinus Huber, Michael Trubetskov, Wolfgang Schweinberger, Philip Jacob, Mihaela Žigman, Ferenc Krausz, Ioachim Pupeza
2024/07/29
Standardized Electric-Field-Resolved Molecular Fingerprinting
A molekuláris vibráció pulzatilis gerjesztése és ennek detektálása mezőfelbontású infravörös spektroszkópiával (FRS) felülmúlhatja a hagyományos idő-integrált spektroszkópia érzékenységét, mert időben szétválasztja a molekuláris jelet a gerjesztő fény okozta zajtól. A számunkra fontos rezonancia-válasz, ami a molekuláris jelet hordozza, függ azonban a gerjesztés amplitúdójától és fázisától is, ami a különböző műszereken eltérő lehet és idővel is változhat. Ez megnehezítette eddig az FRS-mérések összehasonlítását, pedig a gyakorlati felhasználás szempontjából ez döntő jelentőségű lenne. Ezért egy olyan adatfeldolgozási eljárást alkalmaztunk, amely kiküszöböli az előbbi hiányosságot, megőrizve közben az FRS érzékenységét. A módszert molekulák vizes oldatain validáltuk. Az alkalmazott megközelítés kompatibilis az infravörös spektrumok elemzésének bevett feldolgozási és kiértékelési módszereivel, valamint alkalmazható adatbázisokból származó, korábban lemért spektrumokon is, így elősegíti az FRS elterjedését a molekulaelemzések új felhasználási területein.
Publikáció helye: Analytical Chemistry
Olvassa el online
PDF megnyitása
Tarek Eissa, Cristina Leonardo, Kosmas V. Kepesidis, Frank Fleischmann, Birgit Linkohr, Daniel Meyer, Viola Zoka, Marinus Huber, Liudmila Voronina, Lothar Richter, Annette Peters, Mihaela Žigman
2024/07/05
Plasma infrared fingerprinting with machine learning enables single-measurement multi-phenotype health screening
Az infravörös spektroszkópia hatékonyan képes vizsgálni a testfolyadékok molekuláris összetételét, és ígéretes módszere lehet a jövőben a nagy áteresztőképességű in vitro diagnosztikának. Egy populációs kohorsz vizsgálat segítségével 3169 személy 5184 vérplazmamintáját elemeztük Fourier-transzformációs infravörös (FTIR) spektroszkópia segítségével. Többszörös besorolást alkalmazva, hogy elkülönítsük a vérzsír eltéréseket, a magasvérnyomás-betegséget, a prediabetest, a 2-es típusú cukorbetegséget és egészséges állapotot, azt találtuk, hogy az algoritmus pontosan képes elkülöníteni az egészséges egyéneket és jellemezni a krónikus többszörös zavarokat. Megállapítottuk továbbá, hogy módszer évekkel előre képes jelezni a metabolikus szindróma kialakulását. Ez a tanulmány jelentheti az alapját annak, hogy az infravörös molekuláris ujjlenyomat vizsgálat populációs szintű vizsgálómódszerré válhasson.
Publikáció helye: Cell Reports Medicine
Olvassa el online
PDF megnyitása
Alexander Weigel, Philip Jacob, Wolfgang Schweinberger, Marinus Huber, Michael Trubetskov, Patrik Karandušovský, Christina Hofer, Theresa Buberl, Tatiana Amotchkina, Maximilian Högner, Daniel Hahner, Philipp Sulzer, Alfred Leitenstorfer, Vladimir Pervak, Ferenc Krausz, Ioachim Pupeza
2024/05/28
Dual-oscillator infrared electro-optic sampling with attosecond precision
Az infravörös elektromos mezők elektro-optikai mintavétele érzékenységi és dinamikai rekordokat állított fel a szélessávú molekuláris rezgésspektroszkópiában. Ezekben a munkákban azonban az 1 másodperces, egyetlen jelalakot eredményző adatgyűjtési idő a pásztázáson belüli zajfelhalmozódáshoz vezet, és korlátozza az átereszőképességet több minta és dinamikus folyamatok mérésénél. Bemutatunk egy kettős lézer-oszcillátoros megközelítést, amely másodpercenként 2800 közép-infravörös hullámformát rögzít a mintavételezett hullámforma és a kapuimpulzusok közötti relatív késleltetés modulált ismétlési frekvenciazárral történő letapogatásával. Az elektro-optikai késleltetéskövetés (EODT) új technikája akár néhány attoszekundumos pontosságú késleltetés-kalibrációt biztosít, és általános utat nyit a pikoszekundumos késleltetési tartományokkal rendelkező, nagy pontosságú kettős oszcillátoros spektroszkópiához. Munkánk azonnali alkalmazásokat kínál például a precíziós elektromos mező mérés és a nagysebességű bioérzékelés területén.
Publikáció helye: Optica
Olvassa el online
PDF megnyitása
Maciej Kowalczyk, Arun Paudel, Aleksandar Sebesta, Philipp Steinleitner, Nathalie Nagl, Markus Poetzlberger, Vladimir Pervak, Ka Fai Mak, Alexander Weigel
2023/06/21
Ultra-CEP-stable single-cycle pulses at 2,2 µm
A szabályozható vivő-burok fázisú (CEP) egyciklusú optikai impulzusok képezik az alapot az anyag nemlineáris polarizációjának szub-femtoszekundumos időskálán történő manipulálására.
A 2,2 µm-en 6,9 fs, egyciklusú impulzusok rendkívül stabil forrásáról számolunk be, amely egy 22,9 MHz-es ismétlési frekvenciájú, közvetlenül diódával pumpált Cr:ZnS oszcillátoron alapul. A szimulációkkal való kiváló egyezés pontos képet ad a mögöttes nemlineáris impulzus terjedéséről.
Publikáció helye: Optica
Olvassa el online
PDF megnyitása
Tarek Eissa, Kosmas V. Kepesidis, Mihaela Žigman, Marinus Huber
2023/04/12
Limits and prospects of molecular fingerprinting for phenotyping biological systems revealed through in silico modeling
A molekuláris ujjlenyomatok rezgésspektroszkópia segítségével jellemzik a molekulárisan összetett közegek kémiai összetételét, ami lehetővé teszi a biológiai rendszerekhez kapcsolódó fenotípusok osztályozását. Az olyan tényezők, mint a biológiai változatosság, a mérési zaj, a kémiai komplexitás és a kohorszméret közötti kölcsönhatás azonban nehezíti az osztályozás teljesítményére gyakorolt hatásuk vizsgálatát. Ezeket a tényezőket figyelembe véve olyan in silico modellt fejlesztettünk ki, amely reális, de konfigurálható molekuláris ujjlenyomatokat generál.
Publikáció helye: Analytical Chemistry
Olvassa el online
PDF megnyitása
Shizhen Qu, Arun Paudel, Aleksandar Sebesta, Philipp Steinleitner, Nathalie Nagl, Markus Poetzlberger, Vladimir Pervak, Ka Fai Mak, Alexander Weigel
2022/11/22
Directly diode-pumped femtosecond Cr:ZnS amplifier with ultra-low intensity noise
A bemutatott diódapumpás Cr:ZnS erősítő 2,2 W teljesítményű 35 fs impulzusokat ad le alacsony zajszinttel és nagy stabilitással. Ez az erősítő ígéretes ultrarövid infravörös impulzusok generálására, különösen az ultraérzékeny rezgésspektroszkópiában.
Publikáció helye: Optica
Olvassa el online
PDF megnyitása
Philipp Steinleitner, Nathalie Nagl, Maciej Kowalczyk, Jinwei Zhang, Vladimir Pervak, Christina Hofer, Arkadiusz Hudzikowski, Jarosław Sotor, Alexander Weigel, Ferenc Krausz, Ka Fai Mak
2022/05/26
Single-cycle infrared waveform control
Ez a tanulmány kiterjeszti az ultrarövid fényimpulzusok elektromos mező hullámforma szabályozását a láthatótól a közép-infravörösig. Az egyciklusú infravörös impulzusok létrehozása széles körű alkalmazási területet nyit meg, amely magába foglalja az anyagmanipulációt és a molekuláris ujjlenyomat-vételt biológiai rendszerekben.
Publikáció helye: Nature
Olvassa el online
PDF megnyitása
Kosmas V. Kepesidis, Masa Bozic-Iven, Marinus Huber, Nashwa Abdel-Aziz, Sharif Kullab, Ahmed Abdelwarith, Abdulrahman Al Diab, Mohammed Al Ghamdi, Muath Abu Hilal, Mohun R. K. Bahadoor, Abhishake Sharma, Farida Dabouz, Maria Arafah, Abdallah M. Azzeer, Ferenc Krausz, Khalid Alsaleh, Mihaela Žigman, Jean-Marc Nabholtz
2021/12/02
Breast-cancer detection using blood-based infrared molecular fingerprints
Az emlőrák szűrése jelenleg főként mammográfián alapul, de hajlamos téves eredményekre, ezért szükség van új módszerek kidolgozására a korai felismerés javítása érdekében. Ebben a tanulmányban a vérplazma FTIR-spektroszkópiával történő vizsgálatának lehetőségeit vizsgáltuk, ami egy gyors és költséghatékony technika, és segíthet a molekuláris alapú emlőrák diagnózisban.
Publikáció helye: BMC Cancer
Olvassa el online
PDF megnyitása
Marinus Huber, Kosmas V. Kepesidis, Liudmila Voronina, Frank Fleischmann, Ernst Fill, Jacqueline Hermann, Ina Koch, Katrin Milger-Kneidinger, Thomas Kolben, Gerald B Schulz, Friedrich Jokisch, Jürgen Behr, Nadia Harbeck, Maximilian Reiser, Christian Stief, Ferenc Krausz, Mihaela Žigman
2021/09/13
Infrared molecular fingerprinting of blood-based liquid biopsies for the detection of cancer
A humán biofluidokon FTIR spektroszkópiával végzett közelmúltbeli omikai vizsgálatok rávilágítanak arra, hogy az infravörös molekuláris ujjlenyomat képes kimutatni a mell-, hólyag-, prosztata- és tüdőrákot, 0,78 és 0,89 közötti AUC-értékekkel. Ezek az eredmények egyedi spektrális mintázatokat tárnak fel minden ráktípus esetében, és megalapozzák a költséghatékony onko-IR-fenotipizálást a betegségek hatékony azonosításában.
Publikáció helye: eLife
Olvassa el online
PDF megnyitása
Cristina Leonardo, Johannes B. Mueller-Reif, Liudmila Voronina, Philipp E. Geyer, Marinus Huber, Michael Trubetskov, Kosmas V. Kepesidis, Jürgen Behr, Matthias Mann, Ferenc Krausz, Mihaela Žigman
2021/04/21
Molecular origin of blood-based infrared spectroscopic fingerprints
Az infravörös spektroszkópia segítségével feltárhatjuk a betegségek által indukált molekuláris szintű változások mérhető infravörös jellemzőit folyadék biopsziák felhasználásával. Ez az összetett módszer a proteomika, a spektrális adatok és a gép tanulás alkalmazásával segítségünkre van a minták infravörös spektrumának jobb megértésében és alkalmazásában a különböző betegségek kutatása során.
Publikáció helye: Angewandte Chemie
Olvassa el online
PDF megnyitása
Marinus Huber, Kosmas V. Kepesidis, Liudmila Voronina, Maša Božić, Michael Trubetskov, Nadia Harbeck, Ferenc Krausz, Mihaela Žigman
2021/03/08
Stability of person-specific blood-based infrared molecular fingerprints opens up prospects for health monitoring
Az egészséges egyének vérserum- és vérplazmamintáinak FTIR spektroszkópia segítségével végzett vizsgálata azt mutatja, hogy a véralapú infravörös spektrális ujjlenyomatolvasás megbízható eszköz lehet az egészségi állapot követésére. Ez a módszer egyedi spektrális jeleket szolgáltat a molekuláris jellemzők időben történő változásainak azonosítására és nyomon követésére.
Publikáció helye: Nature Communications
Olvassa el online
PDF megnyitása
Ioachim Pupeza, Marinus Huber, Michael Trubetskov, Wolfgang Schweinberger, Syed A. Hussain, Christina Hofer, Kilian Fritsch, Markus Poetzlberger, Lenard Vamos, Ernst Fill, Tatiana Amotchkina, Kosmas V. Kepesidis, Alexander Apolonski, Nicholas Karpowicz, Vladimir Pervak, Oleg Pronin, Frank Fleischmann, Abdallah Azzeer, Mihaela Žigman, Ferenc Krausz
2020/01/20
Field-resolved infrared spectroscopy of biological systems
A széles sávú optikai koherencia, amely rezgésg által erjesztett molekulák elektro-optikai mintavételezését alkalmazza, ezáltal lehetővé téve a komplex molekuláris szerkezetek érzékeny elemzését élő rendszerekben. A módszer alkalmazási lehetőségei kiterjednek az emberi sejtek, növényi levelek és vérplazma elemzésére egészen kimelekedő érzékenységgel, így széles körűen felhasználható biológiai és orvosi környezetben.
Publikáció helye: Nature
Olvassa el online
PDF megnyitása